Hierdoor kunnen zo meer treinen gaan rijden op het spoortraject Leiden-Utrecht. Auto’s en fietsers kunnen het spoor ongelijkvloers passeren en voor langzaam verkeer richting Cronesteijn is een comfortabele oversteek ontstaan. 

De spooronderdoorgang vervangt de gelijkvloerse kruising op de Kanaalweg met het spoor tussen Leiden en Alphen aan den Rijn. Hiermee verbeteren de veiligheid en doorstroming van het verkeer. Bovendien is deze spooronderdoorgang een voorwaarde voor de frequentieverhoging op het spoortraject Leiden-Utrecht.

De aansluitende wegvakken van de Kanaalweg vanaf de Lorentzkade tot aan de Plantijnstraat zijn verbeterd door onder andere toepassing van geluidsarm asfalt. Hierdoor neemt de hinder van de weg af. Ook is het geluidsarm asfalt nodig voor woningbouwontwikkeling in het gebied Lammenschansdriehoek. De spooronderdoorgang is op 15 september 2017 officieel geopend en heeft de naam Kanaaltunnel gekregen.